Che cos'è una struttura e una funzione enzimatica?

ThinkCo / Miguel Co

Un enzima è una proteina che facilita un processo metabolico cellulare abbassando i livelli di energia di attivazione (Ea) al fine di catalizzare le reazioni chimiche tra le biomolecole. Alcuni enzimi riducono l'energia di attivazione a livelli così bassi da invertire effettivamente le reazioni cellulari. Ma in tutti i casi, gli enzimi facilitano le reazioni senza alterarsi, come il modo in cui il carburante brucia quando viene utilizzato.

Come funzionano

Affinché si verifichino reazioni chimiche, le molecole devono entrare in collisione in condizioni appropriate che gli enzimi possono contribuire a creare. Ad esempio, senza la presenza di un enzima appropriato, le molecole di glucosio e le molecole di fosfato nel glucosio-6-fosfato rimarranno legate. Ma quando presenti il enzima idrolasi , le molecole di glucosio e fosfato si separano.

Composizione

Il peso molecolare tipico di un enzima (il peso atomico totale degli atomi di una molecola) varia da circa 10.000 a più di 1 milione. Un piccolo numero di enzimi non sono in realtà proteine, ma sono invece costituiti da piccole molecole di RNA catalitico. Altri enzimi sono complessi multiproteici che comprendono più subunità proteiche individuali.

Mentre molti gli enzimi catalizzano le reazioni di per sé, alcuni richiedono componenti non proteici aggiuntivi chiamati 'cofattori', che possono essere ioni inorganici come Fe²⁺, Mg²⁺, Mn²⁺, o Zn²⁺, oppure possono essere costituiti da molecole organiche o metallo-organiche note come 'coenzimi'.

Classificazione

La maggior parte degli enzimi è classificata nelle seguenti tre categorie principali, in base alle reazioni che catalizzano:

Ossidoduttasicatalizzare reazioni di ossidazione in cui gli elettroni viaggiano da una molecola all'altra. Un esempio: l'alcol deidrogenasi, che converte gli alcoli in aldeidi o chetoni. Questo enzima rende l'alcol meno tossico poiché lo scompone e svolge anche un ruolo chiave nel processo di fermentazione.Transferasicatalizzare il trasporto di un gruppo funzionale da una molecola all'altra. I primi esempi includono le aminotransferasi, che catalizzano la degradazione degli aminoacidi rimuovendo i gruppi amminici.idrolasigli enzimi catalizzano l'idrolisi, dove i singoli legami vengono scomposti in seguito all'esposizione all'acqua. Ad esempio, la glucosio-6-fosfatasi è un'idrolasi che rimuove il gruppo fosfato dal glucosio-6-fosfato, lasciando glucosio e H3PO4 (acido fosforico).

Tre enzimi meno comuni sono i seguenti:

Liasicatalizzare la rottura di vari legami chimici con mezzi diversi dall'idrolisi e dall'ossidazione, spesso formando nuovi doppi legami o strutture ad anello. La piruvato decarbossilasi è un esempio di liasi che rimuove la CO2 (anidride carbonica) dal piruvato.isomerasicatalizzano i cambiamenti strutturali nelle molecole, causando cambiamenti di forma. Un esempio: l'epimerasi del ribuloso fosfato, che catalizza l'interconversione del ribuloso-5-fosfato e del xilulosio-5-fosfato.ligasicatalizzare la legatura: la combinazione di coppie di substrati. Ad esempio, l'esochinasi è una ligasi che catalizza l'interconversione di glucosio e ATP con glucosio-6-fosfato e ADP.

Esempi nella vita quotidiana

Gli enzimi influenzano la vita di tutti i giorni . Ad esempio, gli enzimi presenti nei detersivi per bucato aiutano a degradare le proteine ​​che causano le macchie, mentre le lipasi aiutano a dissolvere le macchie di grasso. Gli enzimi termotolleranti e criotolleranti funzionano a temperature estreme e sono di conseguenza utili per i processi industriali in cui sono richieste temperature elevate o per il biorisanamento, che si verificano in condizioni difficili, come quelle nell'Artico.

Nell'industria alimentare, gli enzimi convertono l'amido in zucchero, al fine di produrre dolcificanti da fonti diverse dalla canna da zucchero. Nell'industria dell'abbigliamento, gli enzimi riducono le impurità nel cotone e riducono la necessità di sostanze chimiche potenzialmente dannose utilizzate nel processo di concia della pelle.

Infine, l'industria della plastica è alla continua ricerca di modi per utilizzare gli enzimi per sviluppare prodotti biodegradabili.